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根据高等大型真菌的生物学和生态学特点，以及我国菌物科学家长期以来致力研究开发的进展，许多名贵菇菌已被人们驯化栽培，形成产业化商品上市的结果，使名贵菌的类群的划分也发生了新的变化。这里以现有观点，综合刘贵培等(2009)的划分，大体分为以下三类。
(1)濒危类主要是那些菇种因其的生物学特性及对生境要求或因产地分布区域极为狭窄，栖息地或宿主遭到严重破坏，导致种群数量急剧下降，甚至几近绝迹，而且残存的种群仍受到严重的威胁。诸如块菌、松茸、干巴菌、冬虫夏草等。据云南贸易真菌多样性调查考察，濒危类群菇菌只占整个菌物类群的1.1%，说明品种极少，且处境极为濒危。此类品种已引起重视，如松茸已列入国家二级保护植物。
(2)类类群有重大的科学价值，为我国重要的自然生物可利用资源。诸如腹牛肝菌属(Gastroboletus)、红菇属(Russula)、鹅膏属(Amanita)、轴腹菌属(Hydanangi—urn)、鸡纵菌属(Termi tomyces spp)。这些种群有30多种大都属于单型种，中国特有特殊种属，区域性分布代表类群，成为演化过程中的孑遗或残遗种，对生态环境植被恢复具有重要的生物学和生态学意义。人工栽培虽有成功的报道，但只闻其名，市场不见其货，价格仍处贵位。如羊肚菌、牛肝菌、红菇、绣球菌、白参菌、鸡纵菌等虽有报道栽培成功，但市场产品奇缺，现有价格为，羊肚菌干品1 500-3000元/千克，红菇干品400元/千克，鸡纵菌鲜品150元/千克，因此仍然是稳坐“珍”位。
(3)类主要指的依赖天然的林木外生菌根菌和与昆虫类共生的类群。诸如块菌、松茸、牛肝菌、鸡土5L菌、红菇、虎奶菇、紫丁香蘑、鸡油菌、松乳菇、奥德蘑(水鸡纵)、绣球菌、青头菌、珊瑚菌、黄柄鸡油菌(喇叭菌)、梭柄乳头菇(老人头)等。这些品种产品数量极少。《中国食用茼年鉴))2007年统计资料显示：全国松茸产量仅有1 535吨，牛肝菌16172吨，羊肚菌1082吨。这三种产品总和为18789吨，仅占列表统计的食用菌27个品种总产量。682万吨的0.11%，产量极为，身价不凡。因此，对于茵根性和昆虫性食用菌的人工培育，实现可持续利用，一直是世界的难题和创新研究的焦点。
